Cómo abrir un archivo PDB

Protein Data Bank utiliza un formato PDB para almacenar datos estructurales determinados experimentalmente de proteínas y ácidos nucleicos. Un archivo PDB es un archivo de texto que se compone de dos partes: una cabecera y una lista de coordenadas atómicas. La cabecera es típicamente los primeros 300 a 600 líneas del archivo que contiene la información sobre la proteína (por ejemplo, nombre, referencia, secuencia y estadísticas cristalográficas) y es accesible mediante la apertura como un archivo de texto. coordenadas atómicas permitir la visualización de una estructura de la proteína, por ejemplo, el uso de ciertos programas DS Visualizer, que es un software gratuito de Acccelrys Inc.

Instrucciones

con WordPad

1 Navegue hasta el archivo PDB con el Explorador de Windows.

2 Haga clic para ampliar la lista "Otros programas". Desplazarse por la lista y encontrar "WordPad".

3 Haga doble clic en "WordPad" para abrir el archivo PDB dentro del editor.

4 Desplazarse hacia abajo en el archivo y siga las instrucciones de la proteína.

Con Accelrys DS Visualizer

5 Haga clic en "Inicio" de Windows XP / Vista y abrir la lista "Todos los programas".

6 Desplazarse por la lista de programas y encontrar la carpeta "Accelrys DS Visualizer". Abra la carpeta y haga clic en "DS Visualizer" para iniciar el programa. Nota: En lugar de los pasos 1 y 2 puede hacer clic en el icono DS Visualizer en el escritorio.

7 Haga clic en el menú "Archivo"> ​​"Abrir" en DS Visualizer. Vaya a la ubicación del archivo PDB y haga doble clic en el archivo. La estructura debe aparecer en la ventana Visualizador DS.

Instalación Accelrys DS Visualizer

8 Navegar al formulario de inscripción Descubrimiento Studio Visualizer.

9 Rellene el formulario de registro con la información sencilla (su nombre, afiliación, dirección y dirección de correo electrónico). Haga clic en "Enviar."

10 Marque la casilla de correo electrónico indicada en el paso 2 en 3 a 5 minutos. Debería recibir un correo electrónico de Accelrys con el asunto "DS Visualizer ... Información de descarga".

11 Abre el correo electrónico y haga clic en el enlace de la derecha bajo "DS Visualizer para Windows." A continuación, haga clic en "Ejecutar" para guardar el archivo en un directorio temporal y automáticamente iniciar la instalación después de eso.

12 Haga clic en "Ejecutar" de nuevo y luego en "Siguiente" para iniciar la instalación. La instalación tarda de 2 a 4 minutos.